guten Abend!
Bei thunderbird gibt es, soviel ich weiß immer nur einen einzigen Postausgang, nur die Eingänge, Gesendet Entwürfe, Papierkorb und Vorlagenkönnen getrenntsein, der Postausgang ist immer nur einmal vorhanden. Wie groß sind denn die kopierten Mailordner?
Vielleicht lädt Thunderbird deshalb immer nach, weil sie zu
große Bissen für ihn sind.
Komprimiere mal deine beiden Konten mit alt D k, denn da werden ohnehin nur die gelöschten Mails vollständig entsorgt. Vielleicht hilft das ja.