Was genau meinst du? Ich betreibe seit Jahren Dual-Boot Linux/Windows.
In der Standardeinstellung von Linux läuft die RTC auf UTC und das System nutzt die RTC nur als Zwischenspeicher für die Systemzeit zwischen zwei Bootvorgängen. Bootet man Windows und erlaubt das Stellen der RTC auf die lokale Zeit, holt sich beim nächsten Booten von Linux die falsche Zeit aus der RTC.
Man kann Linux zwar mitteilen, daß die RTC auf lokaler Zeit läuft, muß aber gleichzeitig verhindern, daß die RTC unter Linux verändert wird. Dann kommt aber die Drift der RTC zum Vorschein und nach einiger Zeit muß Linux nach dem Booten die Systemzeit aus dem Internet synchronisieren. Das kann ein Problem werden beim Start von Anwendungen, die eine genaue Zeit erfordern.