Ich bin völlig ratlos .
Das werden die Helfer hier auch sein, da du leider die grundlegenden Infos nicht mitlieferst: Zuerst mal die Fragen, die bei Eröffnung des Threads gestellt werden. Dazu in diesem Fall die genauen Einstellungen, die du verwendest... 
[...]
Ich bin völlig ratlos .
Um Rückfragen vorzubeugen, bitten wir um folgende Angaben in Ihrem Text:
• Thunderbird-Version (konkrete Versionsnummer)
• Betriebssystem + Version
• Kontenart (POP / IMAP)
• Postfachanbieter (z.B. GMX)
• Eingesetzte Antivirensoftware
• Firewall (Betriebssystem-intern/Externe Software)
• Router-Modellbezeichnung (bei Sende-Problemen)
BTW: Bei mir geht das Löschen von Mails schneller! 
TB Version 128.2.0 war 64Bit
Hallo,
war 64-Bit oder ist jetzt auch?
Gibt es diese Auffälligkeit erst seit 128.x? Sind die Mails noch auf dem Server vorhanden?
Installiere einmal zur Gegenprobe den TB 115.15.0 als Portable (auf D: oder E:), damit die jetzige Installation nicht tangiert wird.
Richte nur das kritische Konto ein und berichte.
Hallo,
Eigener Server des Adminstrator
D.h., ihr hostet eure eigene Domain? Wenigstens auf einem dedizierten Server in der Cloud oder etwa hinter der Fritz!Box?
Möglicherweise hat der Admin den Server nicht richtig konfiguriert?
Richte nur das kritische Konto ein und berichte.
Ergänzend dazu, nach dem das getestet ist, richte auch mal ein unverdächtiges Konto mit einem der üblichen Anbieter ein (Freemailer wie web.de oder T-Online, ..) und vergleiche das Verhalten im Gegensatz zu eurem Postfach.
Gruß
Sehvornix
Das Konto gelöscht und neu eingerichtet .
Obwohl das besagte Konto noch nicht eingerichtet war ist eine Testmail verschwunden .
D.h. obwohl TB gar nicht aktiv war ist eine Mail verschwunden? Dann kann TB ja wohl nicht die Ursache sein!?
Wohl ein KI Filter, der alles Irrelevante gleich entsorgt 😁
