Das Problem hab ich manchmal auch, mitunter wird dann nur ein Teil der als Spam markierten E-Mails verschoben.
Dass tritt aber nur auf, wenn ich während des Abrufens den Posteingang eingeblendet hab, sonst nie. Halte die Sache also schon für einen eigenartigen Bug.
(Version 1.5.0.12 (20070509))