Bei uns hat sich das Problem auch nur durch weg nehmen des Hakens lösen lassen!
So schaltest man den Haken aus:
Sophos starten, dann im Menü Konfigurieren -> On-Acces-Überprüfung, da auf dem zweiten Tab Erweiterungen findest du ganz unten den Haken Dateien ohne Erweiterung prüfen.
P.s.: Habe Sophos 6.5.2