Ich hatte jetzt mit TB 3.16 das selbe problem.
den pfad in der about:config zu ändern hat bei mir nicht geholfen - der war zwar vollkommen veraltet, aber daran lag es nicht.
was bei mir geholfen hat war das löschen aller dateien im "smart mailboxes" ordner. also aller msf dateien sowie aller dateien die keine endung haben.
die wurden beim ersten neustart alle von TB wieder hergestellt und alles funtioniert.