Habe das gleiche Problem:
Lokaler Ordner doppelt und noch eines der POP3 -Konten doppelt. Sonst alles O.K. auch das IMAP-Konto.
Wenn ich eins der beiden (doppelten) Konten lösche, gehen alle beide weg.
Habe 1. Versuch: Den Ordner Thunderbird von TB3 mit altem Ordner Thunderbird (von TB2) überschrieben
und 2. Versuch: TB2 nach TB3 upgedated. Gleiches Ergebnis.
Kehre jetzt wieder zu TB2 zurück
Matzimaus38