Erstmal Danke an alle für die Antworten.
Da ich 7 E-Mailkonten mit Thunderbird verwalte, ist die Tatsache, dass es sich womöglich um einen BUG handelt doch recht ärgerlich. Ich bin also hinzugegangen und habe zunächst eines der Konten aus der neuen Version entfernt und sofort wieder neu erstellt. Wie durch ein Wunder waren plötzlich alle Ordner und Konten sichtbar.
Leider ließen sich die anderen Konten aber nicht einzeln verwalten, was dazu geführt hat, dass ich im gruppierten Posteingang jede Mail 7 mal hatte. Habe ich eine davon gelöscht, waren alle 7 futsch.
Mir blieb also nichts anderes übrig als alle E-Mailkonten komplett neu unter 3.0.2 einzurichten. Nun läuft es zu meiner Zufriedenheit.
Ist natürlich schade, dass gerade in der wichtigsten Funktion vom Thunderbird beim Updaten ein Fehler auftritt. OK, wenn man es nun weiß ist es OK,
Besten Dank nochmal.