Ich hatte das Problem der doppelten Passwortabfrage auch, bei mir war es die Einstellung "merken, welchen Ordner zuletzt benutzt" im Zusammenspiel mit der Voreinstellung "Mails beim Start automatisch abfragen". Das führt zu zwei Anfragen beim Starten quasi zeitgleich. Wenn ich als letzten Ordner wieder auf dem Posteingang stehe, kommt die Abfrage nur einmalig.