Ich würde den lokalen Ordner gern komplett rausnehmen und extern (außerhalb TB) weiter verwenden.
Das lässt sich manuell und mit TB-Bordmitteln machen, dazu brauchst du kein anderes Programm.
Aber das hat doch in der augenblicklichen Situation überhaupt keinen Sinn, solange dein Thunderbird keine Ordnerliste anzeigt.