Es geht also um Googlemail?
Normalerweise werden die Ordner da und in TB vernünftig angelegt. Das Problem kann durchaus daran liegen, dass 2 Ordner für dasselbe vorhanden sind.
Da es sich um ein IMAP-Konto handelt, würde ich (nach einem Backup des Profil-Ordners wie immer) das Konto in TB löschen, TB beenden, dann den kompleten Mail-Ordner des Googlemail-Ordners innerhalb des Profil-Ordners entfernen und dann das Konto neu einrichten.