Ich hab dasselbe Problem. Thunderbird 17.0.2.
Zum gleichen Zeitraum 1. oder 2. März 2013 auf 2 verschiedenen Rechnern sind alle Mails verschwunden.
(Umfeld Windows8 32 und 64, Virensc. Windows Defender bzw. Avira)
Kann mit dem Problem leben, da ich noch ein anderes Mailprogramm am Laufen habe.