Das bereithalten der Nachrichten ist laut Bugzilla Ticket nicht die Ursache. Das Problem liegt laut Logfiles intern entweder bei der erwähnten Windows-Funktion zum ermitteln des freien Speichers (gibt manchmal 0 aus) oder einem Problem im Quellcode von Thunderbird. Betroffen sind soweit ich weiß nur IMAP-Konten.
Das bestehende Profil hatte ich sogar repariert und einmal an einem Abend alle Mails neu runtergeladen, soweit ich mich erinnere. Hat jedoch keinen Unterschied gemacht.