Super, das hat mir sehr geholfen.
Ich konnte zwar keine vergleichbare Option ich in den Servereinstellungen nicht finden aber es gibt dort auch wieder eine Option "Auto-Joined Channels".
Aufgrund Deines Hinweises habe ich aber einfach mal ausprobiert, ob dort vielleicht auch die Syntax "#channel password" akzeptiert wird und das funktioniert. Thunderbird meldet sich jetzt bei jedem Start erfolgreich beim gewünschten chat an.