Hm, ich dachte, ich habe E:\Thunderbird profile als Profilordner eingestellt (so zu ersehen in Thunderbird - "Informationen zur Fehlerbehebung") und würde nur den sichern. Ich weiß gar nicht, was sich dann noch in %appdata% befindet.
Zusätzlich habe ich noch ein BackUp mit ImportExport Tools eingerichtet. Das sollte hoffentlich reichen.
Danke!