0000 ist der Status von ungelesenen Mails. Wieso sollte ein Posteingang nur ungelesene Mails enthalten ?
Vertipper, 0009 war gemeint.
Vielleicht waren deine "verschobenen" (und nie angekommenen) Mails in der riesigen Mbox-Datei Inbox gar nicht als solche gekennzeichnet worden, sondern diese war beschädigt worden. Durch das Aufteilen der Inbox hast du vermutlich xx kleinere, meist gesunde Mbox-Dateien erhalten, die auswertbar sind.
Vermutlich, soweit ich das überblicken kann fehlt nichts (wichtiges), das Problem ist also gelöst.
Ich werde mein Backup-Verhalten nun anpassen und in Zukunft vorsichtiger sein.
Vielen Dank!