Lösung
Es liegt an der Kombination von IMAP mit maildir. Bin nun zurück zu mbox und es funktioniert wieder, obwohl sich die Profile weiterhin auf dem Netzlaufwerk befinden. Das Speichern auf dem Netzlaufwerk ist also nicht das Problem - vielmehr scheint maildir tatsächlich noch nicht ausgereift. Wie gesagt gab und gibt es bei pop3 Konten in Kombination mit maildir keine Problemen sondern nur mit IMAP, wenn man eine Kopie der Nachrichten lokal behalten möchte.
Danke für die vorherigen Antworten.