Mittlerweile ist mir eine Loesung eingefallen: In den "Lokalen Ordnern" habe ich einen Unterordner fuer jedes E-Mail-Konto angelegt und dortdrin baue ich dieselbe Ordnerstruktur wie auch im IMAP Konto auf. E-Mails von abgeschlossenen Projekten verschiebe ich dort rein und dann sind sie nicht mehr im IMAP und brauchen dort keinen Platz mehr. Da die Projekte abgeschlossen sind, ist es auch nicht schlimm, dass ich diese E-Mails nur am Hauptgeraet sehen kann.
Trotzdem etwas schade, dass es keine andere Loesung gibt.