Ich habe dasselbe Problem. Ich habe die E-Mails auch nach Datum sortiert (neueste unten). Früher sprang das Programm beim Start sowie beim Aufruf eines neuen Ordners immer automatisch nach unten zu den neuesten Mails, das tut es seit der "Supernova"-Version nicht mehr. Das manuelle Runterscrollen ist äußerst lästig.
Ich bin mir sehr sicher, dass das ein Bug ist, der hoffentlich demnächst repariert werden wird.