Hallihallo
das Problem ist nicht neu und wurde scheinbar schon mal gelöst, wobei ich nicht nachvollziehen konnte wie hier am Schluss genau vorgegangen wurde
Komplette Ordnerstruktur inkl. aller email verschwunden
Ich löste das Problem, welches bei mir unter Ubuntu nach dem Update auch auftrat, indem ich einfach ein neues Profil anlegte und dann schlicht die Nachrichten aus dem alten Profil, welche sich im folder Mail finden ins Neue kopierte.
Das ist keine schöne Lösung, reicht mir aber da ich nur die alten Nachrichten brauchte.
Vergiss dabei bloß nicht eine Sicherheitskopie von deinem alten Profil zu machen, falls du unabsichtlich/absichtlich doch was darin änderst.
Gutes Gelingen