PROBLEM GELÖST
Die Lösung war folgende:
1. TB beendet
2. Den Ordner "LocalFolders" kopiert in "NewLocalFolders"
3. TB gestartet
4. In "Konten-Einstellungen" den Eintrag für "Lokalen Ordner" auf "NewLocalFolders" umgestellt. Dies veranlasste einen Neustart von TB und siehe da alle Subordner waren wieder da :-))
5. TB beendet
6. "LocalFolders" gelöscht
7. TB gestartet -> alles noch Ok
8. Den Ordner "NewLocalFolders" kopiert in "LocalFolders"
9. In "Konten-Einstellungen" den Eintrag für "Lokalen Ordner" auf "LocalFolders" umgestellt. Dies veranlasste einen Neustart von TB
10. Kontrolliert ob noch Alles da ist
11. Ordner "NewLocalFolders" gelöscht
Vielen Dank an Alle, die versucht haben zu helfen.