Thunderbird bietet die versteckten Einstellungen security.tls.version.min und security.tls.version.max. Mit diesen Einstellungen lässt sich steuern, welche SSL bzw. TLS-Versionen Thunderbird unterstützen soll. Um die Einstellungen von der Standard-Einstellung abweichend festzulegen, müssen Sie den Konfig-Editor verwenden.
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Es ist manchmal notwendig, ein (halb-)automatisches Update des Thunderbird komplett zu unterbinden - also zu verbieten. Für das Verbieten von Thunderbird-Updates gibt es unterschiedliche Gründe. Ein Systemadministrator könnte verhindern wollen, dass einzelne Anwender das Programm gewollt oder auch unabsichtlich aktualisieren. Aber auch einzelne Anwender wollen vielleicht absolut bei einer älteren Programm-Version bleiben, weil sie gute Gründe dafür haben.
Thunderbird lädt für die Anzeige der E-Mails standardmäßig keine externen Inhalte bzw. Grafiken aus dem Internet. Dadurch wird Ihre Privatsphäre geschützt. Als Standard-Einstellung für die Anzeige von Nachrichten sollten Sie in der Regel außerdem maximal "Vereinfachtes HTML" wählen, auch wenn die E-Mails dadurch weniger bunt und weniger formatiert angezeigt werden.
Thunderbird kodiert Datei-Anhänge für den Versand standardmäßig eingebunden (Englisch: "inline"). Daher stellen viele E-Mail-Programme die Anhänge sofort dar. Da dies von manchen Anwendern als Sicherheitsproblem angesehen wird, wird oft der Wunsch geäußert, die Einstellungen so zu ändern, dass Anhänge nicht eingebunden versendet werden.
Sobald neue E-Mails in Thunderbird empfangen werden, kann man über diese per Ton-Signal (ein Klang oder auch Sound) und/oder Anzeige im Nachrichtenbereich ("Tray", "Systray" oder auch "Systemtray") des Systems informiert werden. In der Regel erscheint der optische Hinweis in der rechten unteren Ecke des Bildschirms. Die Möglichkeiten hängen dabei auch vom verwendeten Betriebssystem bzw. dessen Version ab.
Eine separate Referenz der Konten-Einstellungen macht kaum Sinn. Daher wird hier im Folgenden per Link auf die verschiedenen Anleitungen zum Einrichten der unterschiedlichen Konten verwiesen, wo man nahezu alle Einstellungen findet, die man zu den jeweiligen Konten-Typen machen kann.