Durch inkompatible Themes kann es zu erheblichen Problemen kommen. Dabei kann sowohl das Zusammenspiel mit Thunderbird fehlschlagen, als auch eines Ihrer Add-ons zu Problemen mit einem verwendeten Theme führen.
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Die Benutzeroberfläche des Thunderbird lässt sich (neben anderen Methoden) auch per CSS-Code anpassen. Die notwendigen CSS-Codes müssen in eine Textdatei mit dem Namen "userChrome.css" in einen Unterordner "chrome" innerhalb des Profilordners geschrieben werden.
Der "Fehlerbehebungsmodus" oder früher auch "Abgesicherte Modus" (Englisch: "Safe-Mode") ist eine Art Notfall-Modus, in dem man ein Thunderbird-Profil vorübergehend frei von fremden Add-ons (Themes und Erweiterungen) und ohne die (teilweise problematische) Hardwarebeschleunigung starten kann. Das ist sehr hilfreich, wenn Sie ein defektes Theme oder eine defekte Erweiterung suchen, die eine Fehlfunktion des Programms verursacht oder sogar den Start des Programms verhindert. Sie können das störende Add-on im Add-ons-Manager deaktivieren oder dauerhaft entfernen und anschließend Thunderbird im normalen Modus wieder starten.